Konceptet for Oceanário de Lisboa blev født i slutningen af 1980'erne, da Lissabon blev valgt til at være vært for verdensudstillingen i 1998, der var centreret omkring temaet "The Oceans: En arv for fremtiden". Det blev besluttet, at et af arrangementets højdepunkter skulle være åbningen af et stort akvarium, der skulle fremhæve betydningen af at bevare havet. Arkitekt Peter Chermayeff og hans team stod i spidsen for planlægningen og opførelsen af oceanariet sammen med ekspertisen fra havbiologen Dr. Joao Falcato.







